普通菜豆基因組學及抗炭疽病遺傳研究進展

1、普通菜豆基因組學及抗炭疽病遺傳研究進展普通菜豆基因組學及抗炭疽病遺傳研究進展陳明麗，王蘭芬，趙曉彥，王述民(中國農業(yè)科學院作物科學研究所，北京100081)摘要：普通菜豆是重要的食用豆類之一，在世界各大洲普遍種植。近年來，普通菜豆在遺傳圖譜構建、新標記開發(fā)與利用、抗性基因定位以及比較基因組學等方面取得了很大進展。遺傳連鎖圖譜的構建是基因定位與克隆的基礎，是遺傳研究中的重要內容；利用分子連鎖圖譜鑒定、標記和定位抗病基因將在種質改良和分子標

2、記輔助育種方面發(fā)揮重要作用。豆科植物比較基因組學的研究成果為菜豆遺傳連鎖圖譜的發(fā)展提供了新的思路。本文從普通菜豆遺傳連鎖圖譜的獲得、普通菜豆與大豆同線性比較以及抗炭疽病基因定位等方面進行了綜述，以期為普通菜豆遺傳改良和抗病育種提供參考。關鍵詞：普通菜豆；遺傳連鎖圖；同線性比較；抗菜豆炭疽病CurrentResearchProgress(PhaseolusvulgarisL.)InAnthracnoseResistantGeicsGeno

3、micsonCommonBeanCHENMingliWANGLanfenZHAOXiaoyanWANGShumin（InstituteofCropSciencesChineseAcademyofAgriculturalSciencesBeijing100081）Abstract:Commonbeanisoneofthemostimptantfoodlegumeisgrowninallpartsofthewld.Inrecentyears

4、ithasmadegreatachievementsingeicmapconstructiondevelopmentutilizationofnewmarkersresistancegenemappingcomparativegenomicsofcommonbean.Molecularlinkagemapsareanimptanttoolfgenediscoverycloning.Detectingresistancegenebylin

5、kagemapscanbeusedinmakerassistantedimprovementofcommonbean.Legumecomparativegenomicsresearchprovidedanewwayofdeveloppinggeiclinkagemap.Thispapergivesanoverviewofprogressofcommonbeangeiclinkagemapssyntenymappingbetweencom

6、monbeansoybeangenemappingfanthracnoseresistanceastoprovidesomenewreferencefgenomeresearchmolecularbreedingincommonbean.Keywds:CommonbeanGeiclinkagemapsSyntenycomparativeAnthracnoseresistance收稿日期：修回日期：基金項目：食用豆產業(yè)體系（CARS09）

7、.農作物種質資源保護與利用專項作者簡介：陳明麗，碩士研究生，研究方向為普通菜豆抗炭疽病基因分子標記。Email:sscmlss.cool@.cnRFLPSSR中美地方品種D364與安第斯品種G19833雜交F9重組自交系群體87150個SSR標記圖譜長度為1720cM標記間的平均距離為19.5cM分11個連鎖群。BlairMWetal[10]RAPDSCAR西班牙地方品種echa（起源于安第斯基因庫）與中美品種A252雜交F2群體851

8、97個標記(其中有152個RAPD標記，12個SCAR標記，1個形態(tài)學標記和32個RFLP標記)構建菜豆連鎖圖譜。圖譜覆蓋約1401.9cM，平均每個標記間的距離是7.1cM。CristinaRodrguezSurezetal[11]SSRSCAR哥倫比亞栽培品種ICA與野生種G24404雜交BC2F3:5群體157構建11個連鎖群，平均每個標記間的距離是10.4cM。BlairMWetal[12]ESTSSRRGAAFLP中美品種BA

9、T939與安第斯地方品種JaloEEP558雜交F8重組自交群體78261個標記圖譜長度為1259cM標記間的平均距離為3.0cM分11個連鎖群。LuizRicardoHanaietal[13]CAPsdCAPsRAPD中美品種BAT939與安第斯地方品種JaloEEP558雜交F8重組自交群體75272個標記，圖譜長度1545cM。McConnellMetal[14]3普通菜豆與其他豆類的同線性比較研究植物比較基因組學是從比較不同植物

10、的遺傳連鎖圖譜開始的。植物基因組研究一般首先從模式生物入手，近年來國際上以蒺藜苜蓿作為豆科基因組研究模式植物開展了大量研究。蒺藜苜?；蚪M大小約為470Mbp，與普通菜豆、豌豆、綠豆等基因組大小相近。蒺藜苜蓿與豌豆有非常高的共線性關系普通菜豆和大豆在宏線性水平和微線性水平也有較高的共線性關系是豆科作物比較基因組研究的好材料[15]。研究表明，許多植物之間都存在同線性現象。最早研究植物間的同線性是基于RFLP標記的宏觀比較。通常情況下近緣

11、物種的分子標記序列十分保守，只有發(fā)生同臂倒位時標記的序列才會發(fā)生改變。物種間的宏同線性和微同線性是比較基因組研究的主要內容。宏同線性通常是指通過利用共同的DNA標記進行比較遺傳作圖，或者用同源序列的計算機數據綜合分析作圖，獲得物種間保守基因的排列順序。微同線性通常指的是在一個很短的已經在DNA跨疊群上被確定的序列上的保守基因含量和順序。到目前為止幾乎所有種間微同線性的報道是基于數量有限的特定區(qū)域的比較來研究的，該結論也可能從某一點擴展到