APOB、LIPC、LDLR和LPA基因多態(tài)性與2型糖尿病的關聯研究.pdf

1、目的:研究脂質消化、動員和轉運通路(lipid digestion，mobilization andtransport pathway)上的APOB基因rs679899、LIPC基因rs6078和rs6083、LDLR基因rs3826810、LPA基因rs3798220基因多態(tài)性與廣西地區(qū)人群中2型糖尿病的關聯性。
　　方法:采用病例對照的研究方法，929例2型糖尿病患者和1044例健康對照作為研究對象。采集研究對象的外周靜脈血，

2、利用試劑盒法提取DNA，應用基質輔助激光解析電離飛行時間質譜技術(MALDI-TOF-MS)對5個SNPs(rs679899、rs6078、rs6083、rs3826810、rs3798220)進行基因分型。本研究中成組t檢驗和F檢驗用于計量資料的比較，x2檢驗用于計數資料的比較;采用plink軟件分析hardy-weinberg遺傳平衡檢驗、SNPs等位位點頻率及基因型分布;使用haploview4.2軟件分析連鎖不平衡檢驗(LD)和

3、單倍體分析;多因子降維法(MDR)被用于不同SNPs之間交互作用模型的構建;二分類非條件logistic回歸分析被用于基因-環(huán)境交互作用的分析。以上全部檢驗均采用雙側檢驗，檢驗水準α=0.05。
　　結果:
　　(1)一般人口學特征:經plink軟件計算，剔除76例樣本，最終，本次研究納入2型糖尿病病例890例，對照組1007例，病例組的平均年齡64.79±10.03歲，對照組的平均年齡64.02±9.49歲。病例組和對照組

4、在飲酒情況、BMI、TC、TG、HDL方面的分布差異有統計學意義。
　　(2)不同SNPs與2型糖尿病的關聯分析:所研究的5個SNPs的基因頻率在對照組的分布符合hardy-weinberg平衡定律。在病例組和對照組間，APOB基因的rs679899位點的等位位點分布差異有統計學意義;在女性人群中，LPA基因rs3798220位點在共顯性模型中，CC基因型和TT基因型在病例組和對照組的分布差異有統計學意義;在隱性模型中，TT+CT

5、基因型和CC基因型在病例組和對照組的分布差異有統計學意義。
　　(3)交互作用分析:采用MDR軟件分析，發(fā)現rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四個位點組成的模型，可能存在基因-基因交互作用?；?環(huán)境交互作用采用構建二分類logistic回歸模型的方法，未發(fā)現基因-環(huán)境間存在交互作用。
　　(4)單體型分析:應用haploview4.2軟件進行單體型分析，并未發(fā)現分布有統計學差異的單體型。

6、>　　(5)不同SNPs與血清中脂質代謝指標的關聯分析:在病例組中，LIPC基因rs6078位點基因多態(tài)性與血清中LDL、HDL、TC水平有關，LIPC基因rs6083位點基因多態(tài)性與血清中TC水平有關，LPA基因rs3798220位點基因多態(tài)性與血清中TG水平有關;在對照組中，LIPC基因上rs6083位點基因多態(tài)性與血清中TC水平有關。
　　結論:
　　(1)在女性人群中，LPA基因上rs3798220位點的CC基因型可

7、能是2型糖尿病的易感基因型。
　　(2) rs679899、rs3798220、rs6078、rs6083四個位點可能存在基因-基因交互作用。
　　(3)在LIPC基因rs6078上，攜帶GA基因型可能與T2DM患者血清中LDL、HDL、TC高表達有關聯;攜帶A等位位點可能與T2DM患者血清中HDL和TC高表達有關。
　　(4)在LIPC基因rs6083上，攜帶AA基因型可能與T2DM患者血清中TC升高有關。